选择合适的忍者是通关的关键。根据关卡机制和敌人特性，推荐优先使用具有抓取效果、远程攻击或高爆发输出的忍者。托斯、晓大蛇丸、漩涡玖辛奈少女、山城青叶、羽高和百机蝎等忍者均表现优异。这些忍者不仅能有效应对不同阶段的敌人，还能通过技能组合快速清理小怪或控制BOSS。
针对飞段关卡（三北之章），托斯的抓取技能可有效克制白狼王的扑击和飞段的诅咒法阵。飞段的第一形态需注意走位躲避旋转攻击，第二形态则需避免在法阵内与其交战。地怨虞风掉落的护盾卷轴是抵挡制裁的关键，建议优先击败并拾取。此关卡不推荐选择影响场地技能的印章，以免干扰护盾获取时机。
蝎关卡（青玉之章）分为三个阶段，需应对粘土堆、粘土飞龙和蝎的三种形态。漩涡玖辛奈少女和山城青叶的范围技能可快速清理粘土炸弹，而百机蝎的远程普攻能安全输出。蝎的百机形态会释放炎狱怃阵和机关旋刃，需通过Y轴走位躲避。最终阶段需远离BOSS身前区域，等待终结按钮出现。此关卡同样不建议选择龙卷等干扰场地的印章。
宇智波鼬关卡（朱南之章）需优先击杀通灵乌鸦，避免其召唤额外敌人。鼬的幻象机制要求玩家快速识别本体，攻击幻象效率较低。推荐使用高爆发忍者速攻本体，同时注意躲避火遁和乌鸦技能。照美冥关卡（水影之章）需连续击败长十郎、青和泳装照美冥，羽高或百机蝎的远程普攻可稳定输出。照美冥的终极大范围水遁需提前预留奥义或护盾抵挡。
优先培养抓取型或远程型忍者，并合理搭配印章难度以平衡分数与通关效率。每日挑战和成就分享可获取额外奖励，建议分阶段完成高分挑战。
